Stichting Flutonicon wordt geleid door een bestuur bestaande uit:
Erik Verbeek, voorzitter, dchverbeek@solcon.nl
René de Vos, secretaris, r.j.devos@live.nl
Gerdien Hakstege, penningmeester, gerdien-rosenbrand@hotmail.com
Francien Post, activiteitencommissaris, fjp@xs4all.nl
Erik Verbeek is sinds medio 2006 voorzitter van Flutonicon. Al tijdens zijn studietijd op het Conservatorium in Utrecht werkte hij als fluitist mee aan het Flutonicon Compositieconcours. Naast zijn fluitstudie sloot hij de studie Bestuurskunde aan de Erasmus Universiteit Rotterdam af.
René de Vos is sinds medio 2000 secretaris van Flutonicon. Als enthousiast amateurfluitist is hij deelnemer aan activiteiten van Flutonicon. Hij is in meerdere muziekorganisaties actief als bestuurslid en organisator van muzikale activiteiten.
Gerdien Hakstege is sinds januari 2009 penningmeester van Flutonicon. Zij is enthousiast amateurfluitist, die c-fluit, altfluit en basfluit bespeelt. Regelmatig volgt zij cursussen en workshops. Zij speelt in een kamermuziekensemble en is vast lid van het Flutonicon Fluitorkest.
Francien Post is in het najaar van 2006 bestuurslid geworden van Flutonicon. Zij studeerde bij Abbie de Quant op het Utrechts Conservatorium. Als docente is ze al zo’n 20 jaar actief. In de afgelopen jaren verzorgde zij regelmatig workshops voor Flutonicon. Toen ze gevraagd werd om mee te werken aan een examineringsysteem voor leerlingen van privé-docenten, was ze meteen enthousiast; als privé-docente liep ze al een tijd na te denken over een toetsingssysteem. Ze hoopt als bestuurslid van Flutonicon nog meer haar steentje bij te kunnen dragen aan het fluitspel in Nederland.